Система водоотведения ГО Богданович служит для обеспечения экологической и санитарно-эпидемиологической безопасности зон проживания, труда и отдыха населения. Водоотведение жилищного фонда, организаций и предприятий города осуществляется системой централизованной канализации и нецентрализованной канализации (выгребные ямы).

Централизованная система канализации г. Богданович представляет собой комплекс инженерных сооружений, условно разделённых на две составляющие:

• сеть самотечных и напорных коллекторов, с расположенными на них канализационными насосными станциями (КНС), осуществляющая сбор и транспортировку сточных вод;
• очистные сооружения, осуществляющие очистку сточных вод.

В систему водоотведения входят:

• сети водоотведения протяженностью 74,9 км.;
• 17 канализационных насосных станций, общей производительностью 12,7 тыс. м3/ сутки;
• городские очистные сооружения канализации (ОСК), проектной мощностью 11,5 тыс. куб. м/сутки.

Средний год постройки и ввода в эксплуатацию КНС - 1973 г., самая старая КНС 1963 г. постройки, а самая новая 1984 г.

Очистные сооружения I и II очереди введены в эксплуатацию в 1959 году, III очереди - в 1973 году. Реконструкция очистных сооружений г. Богданович последний раз проводилась в 1989 году.

Сброс очищенных сточных вод производится в р. Кунара.

Системы водоотведения, имеющиеся в сельских населенных пунктах (за исключением п. Полдневой, с. Коменки и с. Байны), представлены в виде нескольких домов объединенных системой самотечных коллекторов, по которым стоки стекают в выгребные ямы, а затем вывозятся ассенизационными машинами к местам хранения. Большинство домов частного сектора имеют выгребные ямы, для накопления и последующего вывоза ЖБО.